Smartfon iPhone SE wyposażony jest w 4-calowy wyświetlacz Retina HD o rozdzielczości 1136 x 640. Obraz jest jasny, a odwzorowanie kolorów stoi na wysokim poziomie. Zastosowana matryca oferuje szerokie kąty widzenia, co pozwala na komfortowe korzystanie z urządzenia.
Aparat główny o rozdzielczości 12 MPix pozwala na wykonywanie ostrych i bogatych w szczegóły zdjęć, a tryb kamery oferuje możliwość rejestracji wysokiej jakości filmów w rozdzielczości 4K. Aparat znajdujący się z przodu urządzenia o rozdzielczości 1,2 MPix wyposażony jest w lampę błyskową, która w oparciu o specjalny kontroler Retina Flash pozwala uzyskać trzy razy jaśniejszy błysk niż standardowo. Dodatkowo dopasowany do światła zewnętrznego błysk lampy True Tone gwarantuje wierne odwzorowanie barw oraz nadaje skórze naturalny i promienny wygląd.
W pudełku wraz ze smartfonem znajduje się zasilacz USB, kabel Lightning-USB oraz wysokiej jakości słuchawki Apple EarPods wyposażone w mikrofon oraz pilota.
System operacyjny iOS 9.3 działa bez zarzutu, a dodane usprawnienia pozwalają na wygodną i szybką obsługę smartfona. Zastosowana funkcja Night Shift oferuje możliwość zmiany barwy i temperatury kolorów, co ma istotny wpływ na wzrok w godzinach wieczornych oraz zapewnia lepszą jakość snu. Smartfon wyposażony jest w 64 GB wbudowanej pamięci.
Czas pracy na baterii to według zapewnień producenta 14 godzin podczas prowadzenia rozmowy w sieci 3G. Czas czuwania sięga do 10 dni, natomiast podczas pracy z Internetem bateria działa bez ładowania do 13 godzin.
Rozlokowanie przycisków funkcyjnych jest niezwykle intuicyjne. Patrząc na smartfona, po lewej stronie znajdują się przyciski zmiany głośności oraz wyciszenia dzwonka. Na górnym panelu dostępny jest przycisk pozwalający na wyłączenie, włączenie, uśpienie oraz budzenie smartfona. Duży przycisk "Początek" znajdujący się na przedniej części telefonu jest jednocześnie czytnikiem linii papilarnych. Na samym dole znajduje się natomiast złącze Lightning.
W dolnej części smartfona znajdują się mikrofony, gniazdo słuchawkowe 3,5 mm, złącze Lightning oraz wbudowany głośnik.
Obudowa wykonana jest z wysokiej jakości aluminium, dzięki czemu smartfon jest niezwykle wytrzymały i elegancki. Kolor obudowy szary.